学校以服务国家发展、推动社会进步为使命，强化基础研究、聚焦前沿交叉、突出工程技术，打造以理学、工学、信息、商科为主，兼备特色人文社科的学科体系。学校坚持志存高远、求真务实的培养理念，培养具有宽厚基础、创新能力、家国情怀、国际视野的拔尖创新人才。

东方理工实行董事会领导下的校长负责制。董事会为学校最高决策机构，同时设立监事会、顾问委员会、校务委员会和学术委员会等。学校打造基金会举办、政府大力支持、党委把方向、董事会领导、教育家办学的新型模式，探索新型治理机构、新型培养模式、新型教育形态、新型学科布局的全新办学理念。